目的：重点分析总量分摊法和个案汇总法这两种机构流向法中医药总费用核算方法的异同，为进一步规范发展中医药总费用核算提供理论基础。方法：采用对比分析法。结果：总量分摊法核算数据依靠宏观统计资料，自上而下核算，对于数据可得性较差的核算具有重要参考价值；个案汇总法自下而上核算，适用于数据可得性强的数据。结论：总量分摊法和个案汇总法均与卫生总费用机构流向法核算框架保持一致，可依据基础数据可得性差异选用适宜的核算方法。建议进一步健全我国中医药统计制度并强化部门间协作，提升核算结果的准确性；尝试引入功能法核算作为补充，进而完善中医药总费用核算体系。